Sebelum bergabung Persib, dia merupakan asisten pelatih di klub Liga Super India, ATK Mohun Bagan (2020-2022).
Manuel Perez berhasil membantu ATK Mohun Bagan menjadi runner up Liga Super India pada tahun 2020-2021.
Kemudian berhasil masuk ke babak 8 Besar Piala AFC 2021/2022.
Pada musim sebelumnya, Manuel Perez bergabung bersama ATK Kolkata dan berhasil membawa klub ini menjuarai Liga Super India.
Dia pun memiliki pengalaman panjang membina pemain-pemain muda U-15, U-17, dan U-19 Atletico Madrid pada tahun 2013-2018.
Baca Juga: Jatuh Saat Mencuci, Seorang Perempuan Korban Tenggelam di Sungai Cikunten Tasikmalaya
Sebelum menjadi pelatih, dia merupakan pemain yang menimba ilmu di Las Rozas CF. Dia masuk ke tim utama pada 2007. Namun, kariernya tak lama sebagai pemain yakni pada 2007-2010.
Setelah itu, dia menimba ilmu di Inggris. Dia sempat bergabung dengan Akademi West Ham United sebagai asisten manajer tim U-16 pada 2010-2011.
Setelah West Ham, dia kembali ke Spanyol dan menjadi pelatih CF Rayo Majadahonda Youth pada 2011-2013.