Sementara Persita Tangerang berada di Grup CC bersama Putra Jombang, Farmel FC, dan Persipa Pati
Di Grup AA, terdapat Deltras Sidoarjo, Persedikab Kediri, PSDS Deli Serdang, dan PS Palembang.
Untuk pelaksanaan pertandingan, grup AA dan BB akan digelar di Stadion Gelora Joko Samudro, dan Grup CC dan DD akan digelar di Stadion Gelora Deltra Sidoarjo.
Kickoff 16 Besar digelar pada 6 Maret sampai dengan 13 Maret 2022.
Berikut ini hasil pengundian Liga 3 Babak 16 Besar 2021/2022.
Grup AA
Deltras Sidoarjo
Persedikab Kediri